毛巾有下水道的味道主要还是因为卫生间不透风，长时间潮湿导致的。最好的办法就是注意保持卫生间的干燥通风，毛巾在浴室放置一段时间后，要拿出去晒晒太阳，去除霉菌。还可以用白醋浸泡毛巾半小时，然后拿着毛巾的一个角抡着圈甩一会儿，把毛巾上的小线圈都甩开了，晾干再用，这时毛巾摸上去会感觉松软，还可以防止滋生细菌。
毛巾长期处在潮湿环境，在加上不通风，是会有很重的异味的。毛巾是纤维织物，使用时间长了，深入纤维缝隙内的细菌很难清除，而清洗、晾晒、高温蒸煮等方式只能在短时间内控制细菌数量，并不能永久清除细菌。长期使用旧毛巾的话，会给细菌入侵造成机会，所以，最好三个月左右换一块新毛巾。
卫生间本来就是一个排污的地方，要是没有经常清洗卫生间的话难免会有一股臭味，所以可想而知毛巾放在卫生间多少都会吸收一些味道。还有毛巾沾了水，没有及时晾干，而且放在比较潮湿的卫生间，也会产生一股异味。对于毛巾难闻的味道，可以用洗衣粉之类的洗涤剂浸泡半小时，然后清洗，最后晾干，最好是在通风的太阳光下晒，可以达到杀菌的效果。有条件的话，洗之前先用84消毒液等带有氯化物的消毒用品浸泡20分钟，晾干后就没味儿了。而且毛巾使用过之后，一定要挂起来晾干，不要弄成一堆，就不会产生难闻的气味了。
如果毛巾长时间放在卫生间，不仅有味道还会滋生细菌，必须定期对毛巾杀毒，可采用煮毛巾消毒法，大概每一个月煮一次毛巾，将毛巾放入锅中，倒入开水，并放入少许盐，先开大火煮开，然后转成中火继续煮15分钟，煮好后待水冷凉，将毛巾取出，拧干水分，晾晒到太阳下晒干，可以起到消毒除菌的作用。