主卧上面是厕所，一定是楼上的装修改变了房屋使用的用途了，可到房产主管部门及社区协调处理。 具体健康我不知道是否有影响，关键是一旦在没有房水层的房间里设洗手间，漏起水来谁能吃的消，那房子还住不住了。
没关系！只要楼上的厕所不漏水